이상훈 교수는 퇴행성 척추질환의 진단 기법 및 최소침습적 치료 방법, 목 디스크 및 척추기형에 대한 치료 결과에 대한 지속적인 연구를 시행했으며, 이에 관련된 30여편의 논문을 SCI 학술지 등에 발표해 오고 있다.
또한 2003년부터 5년 연속 대한정형외과학회, 대한척추외과학회, 아시아태평양 미세침습척수시술학회, 미국경추연구학회 등 국내외 학회에서 우수논문상을 수상하기도 했다.
이 교수는 현재 Asian spine journal 심사위원과 대한척추외과학회 기초연구회 및 경추연구회 위원, 북미척추외과학회, 미국경추연구학회 회원으로 활동하고 있다.