경영실적평가(04년) 결과 건강보험심사평가원은 비교유형 13곳중 3위를 차지한 반면 공단은 10위를 차지했다. 연·기금 운용 유형에 포함된 국민연금공단도 15곳중 3위를 기록, 준수한 성적을 거뒀다.

기획예산처가 정부산하기관 87곳을 8개 유형별로 분류해 경영성과를 평가한 결과, 문화·국민생활유형 13곳에 포함된 심평원은 72,48점을 받아 3위를, 공단은 61.27점에 그쳐 10위를 기록했다.

문화·국민생활분야 13곳의 평균은 66.67점이었으며 한국정보문화진흥원이 81.54점으로 가장 높은 점수를 받았다. 점수가 가장 낮은 기관은 한국소방검정공사.

연·기금운영 유형에 분류된 국민연금관리공단은 73.81점으로 한국수출보험공사, 한국산업안전공단 등에 이어 15곳중 3위를 기록했다.