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전자의무기록 시스템 전면 개편… 병의원 행정부담 낮춘다

발행날짜: 2026-05-07 12:01:51 업데이트: 2026-05-07 12:15:37

복지부, 관련법 고시 개정 통해 복잡한 인증 하나로 통합
제품인증 사용인증 복수 규제 폐지…사후관리체계도 강화

[메디칼타임즈=임수민 기자] 그간 중복된 심사 절차와 과도한 행정 업무로 인해 의료기관의 참여가 저조했던 전자의무기록(EMR) 시스템 인증제도가 전면 개편된다.

복잡했던 인증 종류가 하나로 통합되고 모호했던 변경심사 기준이 명확해짐에 따라, 일선 병·의원의 제도 진입 장벽이 대폭 낮아질 전망이다.

보건복지부(장관 정은경)는 '전자의무기록시스템 인증제도 운영에 관한 고시' 개정안을 확정 및 시행한다고 7일 밝혔다.

정부가 의료기관의 부담을 낮추기 위해 EMR 시스템을 전면 개편한다.

이번 개정은 의료법 제23조의2에 근거한 전자의무기록(EMR) 시스템 인증제도의 운영 효율성을 높이고, 의료 현장의 행정 부담을 줄이기 위해 마련됐다.

전자의무기록(Electronic Medical Record)이란 환자 정보, 진단, 처방, 검사결과, 수술· 입퇴원 기록 등을 전자서명이 기재된 전자문서로 작성한 진료기록을 뜻한다.

그간 EMR 시스템 인증제도는 의료기관의 표준화된 시스템 도입을 유도하기 위해 제품인증과 사용인증으로 구분해 운영됐다.

제품인증은 EMR 시스템이 인증기준에 부합하는지를 심사하는 것이고, 사용인증은 의료기관이 인증받은 EMR 시스템을 기능 변경 없이 사용하는지 심사하는 것이다.

하지만 사용인증은 제품인증과 심사기준이 상당 부분 중복되고, 심사 절차에 따른 부담으로 의료기관의 참여율이 11%로 저조하다는 지적이 있어 왔다. ​이에 보건복지부는 의료 현장의 상황을 적극 반영해 제도를 전면 개편했다.

우선, 제품인증과 사용인증 구분을 폐지하고 EMR 시스템 인증으로 일원화해 인증 종류를 단순화한다.

이에 따라 시스템 개발사나 시스템을 자체 개발한 의료기관이 인증기관(한국보건의료정보원)에 신청하면, 통합된 기준에 따라 심사가 진행된다.

기존의 제품인증 또는 사용인증을 받은 시스템은 해당 유효기간까지 인증이 유지되며, 만료 시 갱신 신청을 하면 된다.

인증 변경심사 대상 기준 또한 명확히 한다. 기존 고시의 '인증 기준과 관련된 중대한 변경'이라는 모호한 신고 기준을 '인증 기준에 관한 기능을 변경 또는 삭제하는 경우'로 명확하게 규정해 현장의 혼선을 방지했다.

끝으로, 인증 사후관리 체계를 강화한다.

그간 별도의 사후점검 체계가 미비했으나, 앞으로는 인증 취득 기관이 시스템 기능을 변경 또는 삭제하거나 인증기관(한국보건의료정보원)이 점검이 필요하다고 판단할 경우, 해당 기관이 자체점검결과서를 제출하도록 근거를 마련했다.

이를 통해 인증 이후에도 시스템 품질이 상시 유지될 수 있도록 실효성 있는 모니터링 체계를 구축했다.

김현숙 첨단의료지원관은 "이번 고시 개정은 의료기관의 행정 부담은 줄이되 시스템 품질과 안전성은 보다 촘촘하게 관리하기 위한 것"이라며 "국민이 안심하고 이용할 수 있는 디지털 의료 환경을 만들기 위해 제도를 지속적으로 개선해 나가겠다"고 밝혔다.

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